Creada la Universidad de Chiclayo y luego de 17 años de funcionamiento, la Asamblea Universitaria en su sesión extraordinaria de fecha 09 de Julio de 2002, acordó aprobar el Proyecto Integral de la Creación de la Filial Jaén.
En agosto de 2002, la Filial Jaén inicia sus actividades académicas en la provincia de Jaén, Departamento de Cajamarca con las Facultades de:
- Educación.
- Ingeniería Informática y de Sistemas.
- Ciencias Empresariales y de Negocios.
- Derecho y Ciencias Políticas.
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La Resolución Nº 234-2004-ANR del 02 de Julio de 2004 se resuelve el funcionamiento de la Filial Jaén de la Provincia de Jaén.
A la fecha cuenta con las Escuelas Profesionales:
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- Educación Primaria.
- Ingeniería Informática y de Sistemas.
- Administración.
- Psicología.
- Tecnología Médica.
- Educación Física.
- Contabilidad.
- Enfermería.
- Derecho.
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Cuenta con programas de licenciatura en educación primaria, modalidad mixta, complementación académica en contabilidad, administración, ingeniería informática y de sistemas y el Programa Profesional por Experiencia Laboral (PEPEL) en administración e Ingeniería Informática y de Sistemas.
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